Mabrouka innove avec la certification de ses porte-greffes et ses plants d'agrumes,certifiés par le Ministère de l'Agriculture, des Ressources Hydrauliques et de la Pêche en Tunisie depuis 2012.
D'autres produits sont également en cours de certification.
Mabrouka accorde une grande importance à la collaboration avec diverses institutions telles que l'APIA, l'INRAT, le GIFruit, le GIL, l'Institut de l'Olivier, l'INAT, l'ISA-CM, l'ESAM, l'INRST et l'INRGREF, pour garantir la qualité et l'excellence de ses produits.